在多领域攻势全面推进的同时，联盟并未忽视后方的稳固。虚空教团的入侵给多元宇宙带来了严重的生态破坏，元初文明母星及周边星球的部分区域仍残留着虚空能量污染，随时可能引发次生灾害；同时，为了防范敌人可能的垂死反扑，联盟需要构建全方位的防御体系，确保后方安全，为前线攻势提供坚实保障。生态修复与防御加固的同步推进，形成了 “攻防一体、前后呼应” 的全域态势，让联盟的攻势没有后顾之忧，最终锁定胜局。
“生态修复第一阶段：全域净化虚空污染！” 光耀大长老和绿野族大长老联合牵头，组建 “生态修复军团”，制定 “分层净化、逐步恢复” 的方案。针对不同程度的污染区域，采取差异化的净化手段：重度污染区（虚空能量浓度超过 50%），由圣光舰队释放 “全域圣光浴”，配合绿野族的 “生命之泉灌溉”，快速降低能量浓度；中度污染区（30%-50%），部署 “净化符文阵” 和 “净化灵树”，通过符文能量和植物吸收，逐步净化污染；轻度污染区（低于 30%），由灵植机器人进行常态化清理，同时种植抗污染植被，巩固净化效果。
生态修复军团在元初文明母星展开了大规模行动。圣光舰队的战舰在重度污染区上空盘旋，金色的圣光如同细雨般洒落，原本漆黑的土地逐渐恢复本色，空气中的刺鼻气味慢慢消散；绿野族的灵植医师在污染区种植净化灵树，灵树的根系快速生长，深入土壤吸收虚空能量，枝叶展开释放氧气，短短三天时间，中度污染区就长出了绿色的嫩芽；灵植机器人在轻度污染区穿梭，喷洒净化药剂，修剪受污染的植被，让生态环境逐步恢复生机。
除了元初文明母星，生态修复军团还派出分队，前往其他受影响的星球进行净化。在 “蓝星”—— 一颗被虚空教团短暂占领的星球，修复分队用了五天时间，净化了所有污染区域，帮助蓝星文明重建家园。蓝星文明的首领感动地表示：“联盟不仅拯救了我们，还帮助我们恢复了家园，我们将永远铭记这份恩情，全力支持联盟的一切行动。”
“防御加固第二阶段：构建多维防御体系！” 铁穹主宰和灵曜星议长负责防御部署，打造了 “三层防御网”：外层为 “时空预警网”，在多元宇宙壁垒的关键节点布置一万个时空预警器，能够提前七十二小时探测到虚空能量波动，为联盟提供充足的反应时间；中层为 “舰队巡逻网”，由联盟各文明的战舰组成二十支巡逻舰队，在元初文明母星及周边星域常态化巡逻，随时拦截可能的入侵势力；内层为 “地面防御网”，在元初文明母星的重要区域（联盟总部、科研中心、后勤枢纽）构建符文防御结界和能量护盾，部署机甲部队和地面火炮，防范敌人的地面突袭。
防御体系的构建很快发挥作用。在一次巡逻中，联盟舰队发现了一艘试图潜入元初文明母星的虚空隐形侦查舰，预警器提前探测到其能量波动，巡逻舰队迅速合围，将其摧毁，避免了一次潜在的偷袭。“多维防御体系已经形成闭环，任何敌人的反扑都将在第一时间被发现和拦截！” 铁穹主宰向张川汇报时，语气充满了自信。
生态修复与防御加固的完成，让联盟的后方彻底稳固，前线部队可以毫无顾忌地全力推进清剿行动。此时的虚空教团残余势力，仅剩下最后一处据点 —— 隐藏在时空夹缝深处的 “虚空圣殿残余”，这里聚集了虚空教团的最后一批核心成员，包括三名虚空长老和五百余名精锐战士，他们试图利用时空夹缝的特殊性负隅顽抗，甚至策划着最后的疯狂 —— 引爆自身能量，污染一片星域。
张川召集所有核心成员，下达了最终清剿指令：“各部队整合力量，对虚空圣殿残余发起总攻！军事部队正面突破，技术部队干扰时空波动，资源部队切断能量供应，心理部队继续广播投降政策，生态部队做好战后净化准备！这是我们的最后一战，务必彻底消灭所有残余势力，还多元宇宙一个永久的和平！”
总攻如期发起。联盟舰队在时空夹缝入口处展开，多元净化炮同时开火，撕裂了虚空圣殿的防御结界；暗影族和时空守护者潜入圣殿内部，摧毁了能量核心；灵能机甲部队和星刃部队冲入圣殿，与虚空长老展开激战；心理部队通过广播，向里面的精锐战士喊话，劝其投降。
战斗异常激烈，三名虚空长老燃烧自身能量，爆发出远超平时的战力，但在联盟的多元攻势下，最终相继被斩杀；五百余名精锐战士中，三百余人选择投降，两百余人顽抗到底，被联盟部队彻底消灭。当最后一名虚空战士倒下时，虚空教团的残余势力被彻底清除，这场持续已久的多元宇宙战争，终于画上了圆满的句号。
战后，联盟在元初文明母星举行了盛大的胜利庆典，各个文明的代表齐聚一堂，共同庆祝和平的到来。张川站在庆典的高台上，望着台下欢呼的人群，心中充满了感慨：“这场胜利，属于多元宇宙的每一个文明，属于每一位为和平而战的战士！是团结、正义、信念，让我们战胜了强大的敌人。未来，我们将继续守护多元宇宙的和平，促进文明之间的交流与合作，让战争永远成为历史，让和平与繁荣永驻！”
欢呼声传遍整个元初文明母星，响彻整个多元宇宙。联盟的多领域全域攻势，不仅彻底粉碎了虚空教团的阴谋，更奠定了多元宇宙的和平秩序。