结晶塔内部并非想象中的迷宫，而是一个光怪陆离、不断变幻的晶体空间。通道扭曲延伸，墙壁如同巨大的棱镜，折射出无数个小智、伊利斯和皮卡丘的身影，让人头晕目眩。
空气中弥漫着一种低沉的嗡鸣，像是无数个细小的声音在窃窃私语，那是未知图腾们精神力量的低语。
“这里的感觉……比外面更不舒服了。”伊利斯警惕地环顾四周，绿色的短发似乎都因为周遭强大的能量场而微微飘动。她的妙蛙花跟在她身边，沉重的步伐踏在光滑如镜的水晶地面上，发出沉闷的声响。
“皮卡丘！（小心，有东西在靠近！）”皮卡丘突然竖起耳朵，指向通道前方。
前方的水晶如同水银般流动、汇聚，迅速凝结成一个人形。光芒散去，出现的不再是那个年幼的小美，而是一位身材高挑、穿着华丽水晶长裙的少女。
她的面容依稀有小美的轮廓，但眼神冰冷，带着一种与年龄不符的疏离和威严。她的身旁，那只威猛如山、鬃毛如炽焰的传说宝可梦——炎帝，发出低沉的咆哮，金色的瞳孔锁定闯入者。
“离开这里。”‘长大的小美’开口，声音空灵而带着命令的口吻，“这里是属于我的完美世界，不容外人打扰。”
“小美！你醒醒！”小智上前一步，毫不畏惧地迎着炎帝充满压迫感的目光，“这不是真实的世界！这是未知图腾根据你的记忆和愿望创造出来的幻象！你的爸爸还在等着你！”
“爸爸就在这里。”‘小美’冷漠地回应，她身边的水晶一阵波动，凝聚出秀力博士的幻影，微笑着揽住她的肩膀，
但那笑容僵硬而无神。“而我，也不再是那个只会无助哭泣的小女孩了。想要前进？那就用实力证明你们有资格打扰我的安宁吧。”
她轻轻一挥手：“破空焰，让他们见识一下，守护这座塔的决心。”
炎帝——被小美误称为破空焰的宝可梦——向前踏出一步，灼热的气息扑面而来，周围的空气都因高温而扭曲。
“看来不可避免要战斗了。”小刚沉稳地走到小智身前，扔出两颗精灵球，“这里交给我和我的伙伴们。小智，伊利斯，你们继续前进，去找花子阿姨和真实的小美！”
“小刚！”小智有些担心。
“放心，我可是尼比市道馆的前馆主！”小刚自信地笑了笑，他的大岩蛇和小拳石出现在场上，面对传说中的炎帝，虽然体型和气势上有所不及，但眼神同样坚定。“大岩蛇，变硬！小拳石，落石准备！”
“拜托你了，小刚！”小智知道时间紧迫，不再犹豫，和伊利斯、皮卡丘绕过对峙的双方，冲向通道深处。身后传来了炎帝震撼的咆哮和小刚沉稳指挥的声音，以及岩石与火焰碰撞的巨响。
结晶塔的内部结构似乎随着小美的心境在不断改变。小智和伊利斯奔跑着，感觉通道在延伸、旋转，仿佛没有尽头。
突然，前方的水晶墙壁再次波动，炎帝那炽热的身影竟然再次凝聚，挡在了路中央。而‘长大的小美’也缓缓从炎帝身后的阴影中走出，脸上带着一丝嘲弄。
“没用的。在这座塔里，我的意志就是规则。只要我不想让你们过去，你们就永远到不了核心。”她的声音在晶体通道中回荡。
“怎么会……小刚他……”小智心中一沉，难道小刚已经……
“哼，那个训练家确实有点本事，他的大岩蛇防御很坚固。”‘小美’淡淡地说，“但在这里，我的破空焰拥有近乎无限的力量。他只是被暂时困住了而已。现在，轮到你们了。”
炎帝再次发出低吼，蓄势待发。
“小智，不能再前进了！”伊利斯突然拦在小智面前，表情严肃，“这座塔的力量超乎想象，它能在任何地方重现最强的守卫。我们必须先确保退路，或者找到破解幻象本身的方法，盲目冲刺只会被各个击破！”
她转向自己的伙伴：“妙蛙花，用藤鞭拦住前面的路！不能再让小智贸然冲过去了！”
“哒嘞！”妙蛙花低吼一声，数根粗壮的藤鞭破土而出（虽然地面是水晶，但未知图腾的力量模拟了土地），在小智和炎帝之间形成了一道绿色的障碍。
“伊利斯！你干什么！妈妈还在里面！”小智急了。
“就是因为花子阿姨在里面，我们才不能乱来！”伊利斯寸步不让，“你想过没有，如果我们也像小刚一样被挡住甚至打败，谁去救花子阿姨？谁去唤醒小美？”
小智愣住了，看着伊利斯坚定的眼神，又看了看妙蛙花坚实的背影，以及前方虎视眈眈的炎帝和冰冷的小美，他沸腾的热血稍稍冷却。伊利斯说得对，冲动解决不了问题。
就在这时，一阵微弱的、带着担忧的呼唤声仿佛穿透了层层晶体屏障，隐约传来：“小智……是小智吗？”
“妈妈！”小智浑身一震，这声音他再熟悉不过！“妈妈！你在哪里？”
“跟着声音的方向，洛托！”洛托姆手机飞了出来，屏幕上显示出一个微弱的光点信号，“花子女士的波导在那边，虽然很弱，但确实在指引我们，洛托！”
是妈妈！她在试图引导我们！小智瞬间明白了。他不再试图硬闯，而是对伊利斯重重点头：“我明白了！我们跟着妈妈的声音走！”
看到小智冷静下来，改变了策略，‘小美’的眉头微不可查地皱了一下。炎帝想要追击，但妙蛙花的藤鞭如同灵活的巨蟒，
有效地封锁了它的行动路线，飞叶快刀如同绿色的旋风袭向炎帝，虽然无法造成太大伤害，但足以拖延。
小智和伊利斯不再理会身后的战斗，全力朝着那若有若无的呼唤声跑去。通道似乎变得顺畅了一些，那些扭曲的折射也减少了。终于，在穿过一道如同水帘般波动的晶体墙壁后，他们来到了一个广阔的空间。
这里仿佛是塔的心脏，一个巨大的圆形水晶殿堂。殿堂中央，有一个由纯净水晶形成的王座。王座上，坐着的正是那个年幼的、穿着睡裙的、真实的小美。
她的眼神有些迷茫，怀里紧紧抱着一个同样由水晶形成的、像是母亲形象的玩偶。而花子，就站在王座旁，
眼神虽然还有些许被催眠后的朦胧，但显然保留着一丝自我的意识，正是她刚才的呼唤引导了小智。
“妈妈！”小智激动地冲了过去。
“小智！”花子看到儿子，眼中的迷茫迅速褪去，露出了欣慰和担忧交织的神情。她一直被未知图腾的力量影响着，充当着“妈妈”的角色，但母性的本能和对儿子的爱，让她始终保留着一丝清醒。
小美抬起头，看着突然闯入的小智和伊利斯，又看了看身边表情变化的花子，小脸上露出了困惑和不安。“妈妈……？”她怯生生地拉了一下花子的衣角。
“小美！”小智在王座前停下脚步，语气急切但尽量放柔和，“你看清楚！这不是你妈妈！这是我的妈妈！你的爸爸秀力博士也根本没有失踪！他一直在找你！”
“你骗人！”小美猛地摇头，抱紧了怀里的水晶玩偶，周围的未知图腾感应到她的情绪波动，浮现得更多，发出更强烈的光芒，
整个殿堂的晶体都开始不稳定地震动。“爸爸就在这里！妈妈也在这里！你们都是坏人，想抢走我的爸爸妈妈！”
“我们没有骗你！”小智大声说道，他深吸一口气，做出了一个决定。他掏出那部黑蓝相间的洛托姆手机，快速操作了几下，然后将其屏幕对准小美。
“洛托姆，立刻接通关都&城都冠军，渡先生的紧急线路！”
“明白，洛托！正在尝试接通……”洛托姆手机屏幕闪烁了几下，很快，一张英俊而严肃、有着一头显眼红发的面孔出现在屏幕上，背景似乎是联盟总部。
“小智？我现在正在绿色草原的临时指挥中心。情况我已经从大木博士那里了解了。你那边怎么样？找到花子女士和小美了吗？”渡冠军的声音清晰传来，带着令人安心的沉稳。
“渡先生！我们都在一起！请你告诉小美，她的爸爸秀力博士到底在哪里！”小智将手机屏幕更近地对着小美。
屏幕里的渡将目光转向小美，眼神变得温和而坚定：“你就是小美吧？我是宝可梦联盟的冠军，渡。我向你保证，小智没有说谎。你的父亲，秀力博士，在几天前就已经被我们的搜救队在另一处古代遗迹附近找到了。”
小美瞪大了眼睛，难以置信地看着屏幕里那个气势不凡的人。
渡继续说道：“他当时只是昏迷，可能是因为未知图腾的力量发生了空间传送。他现在就在联盟的医院里，身体没有大碍，很快就会完全清醒。他醒来的第一句话，就是询问你的安危。他很爱你，也非常担心你。”
冠军的亲口证实，如同重锤敲碎了小美心中最坚硬的那层冰壳。她呆呆地看着屏幕里渡真诚的脸，又看了看身边眼神温柔、却明显是别人母亲的花子，最后目光落回怀中那个冰冷虚假的水晶玩偶上。
“爸爸……真的……没事？”她的声音带着哭腔，一直支撑着她的幻象开始崩塌。
“嗯！他没事！”小智用力点头，“你看，渡先生是冠军，他不会骗你的！你爸爸很快就能回来见你了！”
“呜……”小美的眼泪终于大颗大颗地掉了下来，怀里的水晶玩偶“啪”地一声碎裂，化作光点消失。周围的未知图腾们发出的光芒也变得紊乱起来，不再稳定。殿堂的震动逐渐平息。
花子蹲下身，轻轻将哭泣的小美搂进怀里，像安慰自己的孩子一样拍着她的背：“好了，好了，没事了……爸爸很快就回来了……”
小美在花子温暖的怀抱里，放声大哭，将所有的恐惧、孤独和委屈都发泄了出来。
看到小美的心结解开，小智松了口气，然后抬起头，看向那些依旧漂浮在空中、有些不知所措的未知图腾们。他走上前，语气平和地开口：
“未知图腾，谢谢你们。谢谢你们在小美最孤独害怕的时候回应了她，陪伴她，保护她。”他的话语让未知图腾们的光芒闪烁了一下，似乎有些意外。
“但是，”小智继续说道，“真正的陪伴，不是把她关在一个完美的假象里。真正的家，需要有真实的爸爸和妈妈，需要有可以自由奔跑的草原，需要有朋友，甚至可以有争吵和眼泪。
那才是真实的世界，那才是生活。现在，小美已经不需要这个塔了，她需要回到真实的世界，等待她真正的爸爸回家。”
小智的目光扫过每一个发光的符号：“你们也一定很想回自己真正的家吧？那个属于你们的世界。请打开通道，回去吧。也请让这座塔，让绿色草原，恢复原样。”
未知图腾们沉默（物理上的）了片刻，然后，它们开始以一种和谐的韵律集体闪烁、旋转。强大的精神力量再次汇聚，但这次不再是构筑，而是分解。
殿堂的顶端，空间被撕裂开一道闪烁着奇异光彩的次元裂缝。未知图腾们如同归家的游子，一个个飞入裂缝之中，消失不见。
随着未知图腾的离去，巨大的结晶塔从顶端开始，逐渐化作点点光芒消散。阳光重新洒落，照亮了下方的绿色草原。那座维多利亚风格的大宅重新出现，虽然有些凌乱，但完好无损。
小美在花子的搀扶下站了起来，看着恢复原样的家和广阔的草原，脸上露出了如释重负却又有些茫然的表情。她的冒险结束了，而等待她的，将是与父亲真正团聚的未来。
小智看着妈妈安然无恙，看着小美走出心结，看着危机解除，露出了疲惫却无比欣慰的笑容。皮卡丘也开心地跳上他的肩膀：“皮卡皮卡！（太好了！）”
伊利斯走到他身边，微笑道：“做得不错，小智。”
远方的天空，隐约能听到联盟救援直升机的声音正在靠近。一切都将回归正轨。