广明元年（880年）夏，经过半年的运转，钱镠钱镠深感此前军政安排失于粗疏，常有一人身兼数职之弊。加之战后恢复民生、劝课农桑诸事繁杂，尤其是军中每将直领万人，权责过重，致使刺史府威权难以彰显，纲纪无以振肃。为此，钱镠召集众将，于刺史府院内的都堂共议军政。
议事厅内，炭火噼啪，映照着钱镠及其武将凝重而坚毅的面庞。墙上巨大的舆图，已被各种兵力标识所覆盖。
“诸位，”钱镠声音沉静，却带着不容置疑的决断，“年前虽对战兵做了初步整编，但太过粗放，降卒散兵，加之我军原有部众、新募勇士，来源纷杂，号令不一，此乃军中大忌。昔日高仙芝、李光弼之所以能百战不殆，皆因军令统一，纲纪森严。今外患未靖，内忧潜藏，我等首要之务，便是打造一支真正属于我们自己的、指哪打哪的铁军！”
他站起身，走到地图前，手指重重敲在代表苏州、湖州的区域：“现有兵马，约五万之数。吾决意，将此五万人进行重组，并发布相应的定编定禄方案”
此言一出，帐下诸将即便早有心理准备，打散重组，意味着打破原有的一切山头、派系和人情网络，也是钱镠实现全军掌控力的首要体现。
苏州别驾（陈策客串）起身，详细阐述整编方案：“使君明鉴！具体方案如下：
其一，设立亲兵铁卫。10人一伙，设 火长一人； 6火为一队，设 队正一员； 5队一都，设 都头 一员；10都为一军，设军指挥使一员总辖，编制合计三千人。
其二，设立中军牙兵。20人一伙，设 火长一人； 5火为一队，设 队正一员； 5队一都，设 都头 一员；10都为一军，设军指挥使一员；一万五千人，分为武勇左、中、右三军，每军五千，合计一万五千人。
其二，编练外镇军。剩余三万五千人，混合编为七军，每军五千人。编制同中军牙兵之“军”级单位，称湖安军、嘉禾军、靖江军、长城军、德胜军、昆山军；分驻湖州、苏州各要害之地：太湖口、长江南岸、与浙东、润州交界处等。各军主将，定期轮调。
其三，强化水军。增设一水军，辖舟师，兵员三千。编制如前；设水军都指挥使一员；调石马部黑鲛都一千并拣选熟悉水性的湖州、嘉兴兵卒为骨干，扩充兵员至三千人，称靖海军，配以新造之战舰，负责巡弋太湖、东海区域，兼卫护漕运，必要时可溯江作战或支援陆师。
陈策接着宣布：“军饷军俸如下：
亲兵铁卫 俸禄（年俸，含粮饷、帛、钱）：
士卒： 粮 13石，钱 10贯，帛 2匹。 （年俸总值约 25贯）
火长： 粮 14石，钱 13贯，帛 3匹。 （约 30贯）
队正： 粮 15石，钱 15贯，帛 5匹。 （约 35贯）
都头： 粮 20石，钱 20贯，帛 8匹。 （约 48贯）
军指挥使（5000人）： 粮 25石，钱 225贯，帛 10匹，另赐田宅。 （约 60贯）
中军牙兵 俸禄（年俸，含粮饷、帛、钱）：
士卒： 粮 12石，钱 9贯，帛 2匹。 （约 23贯）
火长： 粮 13石，钱 12贯，帛 3匹。 （约 28贯）
队将： 粮 14石，钱 14贯，帛 4匹。 （约 32贯）
都头（500人）： 粮 18石，钱 18贯，帛 6匹。 （约 42贯）
军指挥使（5000人）： 粮 23石，钱 23贯，帛 9匹，另赐田宅。 （约 55贯）
外镇七军 俸禄（年俸，含粮饷、帛、钱）：
士卒： 粮 10石，钱 8贯，帛2匹。 （约 20贯）
火长： 粮 11石，钱 10贯，帛3匹。 （约 24贯）
队将： 粮 14石，钱 12贯，帛 4匹。 （约 30贯）
都头（500人）： 粮 17石，钱 718贯，帛 5匹。 （约 40贯）
军指挥使（5000人）： 粮 22石，钱 20贯，帛 8匹，另赐田宅。 （约 50贯）”
靖海军 俸禄同外兵
同时要求：所有军队调动，超过一军（五千人）者，必须持有钱镠亲自签发的兵符或手令。日常训练由各军主将负责，但需遵循刺史府颁布的统一操典。军需粮饷由刺史府度支司直接供应至各军，绕过地方州县，任何将领不得插手地方财政。
发不完编制和军俸方案，钱镠对众将道：“重组之事，雷厉风行，若有阳奉阴违、暗中串联者，休怪钱某军法无情！然，若诸位倾力配合，待新军成日，诸位皆是新军肱骨，前程岂限于一州一县？”
众将齐齐抱拳：“谨遵使君号令！”
安排好军队改编之后，因为治理百万黎民、推行繁杂政务，需要大量的行政人才。原有的州县官吏，或死于战乱，或逃亡无踪，或昏聩无能，难以承担复兴重任。钱镠特地赴湖州乌程向熟悉大唐官场管制的周逵周刺史进行请教：
“如今州郡空虚，百废待兴，亟需才德之士充任各级官职。然朝廷铨选之制，已近乎停滞，且远水难救近火。吾欲效仿唐初故事，不拘一格，开馆招贤，先生何以教我？”
周逵捻须沉吟片刻，道：“使君之虑甚是。如今之计，当双管齐下：
其一，延续科举，以示正统。请使君行文，公告苏、湖二州，乃至邻近州县，今岁仍依制举行‘乡贡’考试，选拔干才。虽朝廷可能无力举办省试，但刺史府可自行擢优者授予州县佐贰官职，或聘为幕府僚属。此举可安抚士子之心，彰显使君尊唐重文之意。
其二，辟署召聘，务求实用。广泛张贴求贤令，明示所需职位及才干要求。不仅限于诗文之士，凡精通刑名、钱谷、水利、工造、算术者，乃至有一技之长的胥吏、退役的清廉军官，皆可毛遂自荐或由人保荐。由州府设立考课之所，主公亲自面试，查验其能，量才授职。尤其注意招募熟悉本地情形的寒门才俊。
其三，厚给俸禄，明确考绩。如今乱世，贤才亦需养家糊口。需制定优于平时的俸禄标准，并设定清晰的考课之法，优者擢升，劣者汰换，务必使贤能者得其位，食其禄，尽其责。”
钱镠听后大为赞同：“周先生所言，正合我意！”
返回苏州后，钱镠便着手办理，很快求贤令和科举告示迅速张贴于各州县城门、要道。消息传出，许多因战乱流离失所或郁郁不得志的文人、胥吏、技术人员纷纷前来投效。钱镠就苏沪两州文人士子在苏州设下考场和面试之所，钱镠亲自接见拔擢。
广明元年（880年）六月壬丙辰（十五日），钱镠发布了完整的军队部署和人事任职表：
先说军队方面：铁卫军指挥使：钱辰。
牙兵三军：武勇左军指挥使：成及；武勇中军指挥使：屠环智；武勇右军指挥使：王荒（原赵荒，小名王石头）。
外镇七军：湖安军指挥使：朴正雄；嘉禾军指挥使：阮结；靖江军指挥使：刘孟安；长城军指挥使：杜棱；德胜军指挥使：高彦；昆山军指挥使王荣；常胜军钱穆。
水师 靖湖军：指挥使石麻。
这里面有几个地方需要说明，阮结、刘孟安、杜棱均为原八都兵都将；高彦是原湖州将领，本次升任军指挥使，以后论调；王荣是从翁山陈策的翁城军副将提拔起来的；钱穆是最早跟着钱镠一起贩盐的，假名赵穆；值得一提的是杜棱之子杜建徽，出了名的骁勇果敢，现已成年，得其父举荐，在铁卫亲军中任都头。
两州官职也是大胆任用新人：
刺史府三驾马车：别驾（刺史副贰）：陈策。长史（掌州府政务）：沈崧。司马（掌军事行政）： 蒋凝。
户曹参军事（掌户籍、赋税、田亩）： 罗伏。
仓曹参军事（掌仓廪、收纳）： 刘杞。
法曹参军事（掌刑法、狱讼）： 陆仁璋。
士曹参军事（掌工程、水利、工匠）： 陈璋。
盐铁巡院使（新设，掌盐铁专卖）：赵洪。这个得单独说下：直接对钱镠负责，不受州衙节制，负责海盐生产、销售和铁矿开发，乃财政命脉所在。
湖州刺史：周逵； 别驾： 高渭 长史： 李师悦。 司马： 闻人宇。
湖州不设各曹参军事，日常事务由刺史处理，事涉两州的由苏州刺史府各曹统管。
除此之外，钱镠还单独设立了唐制里面没有的几个机构和官职：
琉球总督府：总督：马绰，统管流求岛一切军政事务，靖南军三千水师（石麻调走后扩充）与翁山定波军两千合并为东海舰队，由其统管，另外靖南堡两千驻军（新招募），以及翁山翁城军两千也由其管辖。
设立北海总督府：总督：赵张，统管耽罗岛、清海镇及对倭航线一切军政事物包括贸易护航，星主卫两千、伏波营两千均由其统管。
对外经贸署，类似于清朝理藩院，由陈策兼管，主要是管理对新罗、倭国贸易航线相关事务。
还有一个是暗卫，负责对内外情报搜集，这个是从赵黄手中接管过来，由钱镠自己直管，具体负责人为从耽罗岛调回的赵盈，还把从赵洪飞云都中负责打探情报的人员也合并了进去，后期可能还负责监察、缉捕等工作。