宇宙联军欢庆胜利的同时，云航和艾文带着核心晶体返回联盟总部研究室。当核心晶体再次嵌入时空枢纽的主控台时，时空之心突然爆发出前所未有的金光，无数古老符文在空气中流转，最终凝聚成一段清晰的影像——画面中，时空守护者们站在一座悬浮的银色星球上，将一件散发着七彩光芒的“时空圣物”埋入星球核心，随后对着虚空立下誓言：“守护宇宙时空，直至‘星核文明’归来。”
“星核文明？”艾文盯着影像中的银色星球，“这是我们从未记载过的文明，难道时空之心的终极秘密，就藏在这座星球里？”云航伸手触碰流转的符文，符文瞬间融入他的掌心，一段信息涌入脑海：银色星球名为“星核源地”，是星核文明的母星，而时空圣物能平衡宇宙所有时空节点，防止时空崩塌。
就在两人震惊之际，研究室的探测仪突然发出急促的警报，屏幕上出现一道陌生的能量信号，信号来源正是影像中星核源地的坐标方向。“这信号……不是任何已知文明的波段！”艾文快速解析信号，发现其中夹杂着一段重复的代码，翻译后竟是：“星核源地遇袭，请求支援！”
“星核文明真的存在，而且正在遭遇危险！”云航立刻召集雷蒙和各星域代表，“星核圣物关系到宇宙时空的稳定，我们必须立刻前往星核源地，帮助星核文明！”各星域代表纷纷响应，宇宙联军再次集结，星尘号作为先锋舰，率先朝着星核源地的坐标出发。
经过三天的星际航行，舰队终于抵达星核源地附近。眼前的景象让所有人揪心——银色星球的外层防护罩已布满裂痕，数十艘造型诡异的黑色战舰正不断发射暗绿色光束，攻击防护罩，星球表面的部分区域已被暗绿色物质覆盖，失去了原本的光泽。
“那些黑色战舰的能量波动，和之前的虚空生物完全不同！”艾文的探测仪不断闪烁，“它们的核心能量是‘腐朽之力’，能吞噬星球的生机！”云航握紧操控杆，“先突破黑色战舰的封锁，与星核文明取得联系！”
星尘号带领舰队发起冲锋，主炮同时发射，蓝色光束击中黑色战舰的装甲。但黑色战舰的装甲能吸收部分能量，只留下浅浅的痕迹。反而，黑色战舰发射的暗绿色光束击中联盟战舰的护盾，护盾瞬间被腐蚀出孔洞。“这些战舰的防御和攻击都很诡异！”雷蒙的声音带着焦急。
就在这时，星核源地的防护罩突然打开一道缺口，一艘银色的小型飞船从缺口飞出，朝着星尘号驶来。飞船的通讯频道自动接通，一道温和的声音传来：“我是星核文明的守护者林恩，感谢你们的支援！黑色战舰是‘腐朽族’的舰队，它们想要夺取星核圣物，用腐朽之力摧毁整个宇宙！”
林恩的话音刚落，黑色战舰的舰队突然发起总攻，暗绿色光束如暴雨般袭来。云航立刻下令舰队展开防御阵型，同时对着通讯器说：“林恩，告诉我们星核圣物的位置，我们帮你们守护它！”
“圣物在星球核心的‘星核神殿’，但腐朽族已经突破了星球的外层防线，正在朝着神殿推进！”林恩的声音带着急促，“我可以带你们从秘密通道进入神殿，但我们必须尽快，否则圣物就会被他们夺走！”
云航点头，操控星尘号跟着银色飞船，朝着星核源地的大气层飞去。