大漠的夜风卷着沙砾拍打脸颊，林羽三人循着地图来到鬼哭峡。峡口立着的石碑上，魔医门三字正渗出鲜血，在月光下凝成龙辰-999的编号。苏云萝的玉笛突然发出警报，十二根银针指向峡内的血雾旋涡。
小心！叶尘将苏云萝扑倒在地。血雾中射出的淬毒弩箭擦着林羽耳边飞过，钉在岩壁上腐蚀出青烟。林羽的青龙剑自动出鞘，剑身裂痕中涌出金色血液，将弩箭融化成金水。
这是魔医门的血藤傀儡苏云萝撕开衣襟，露出锁骨下方的龙鳞印记——与三年前被苏云裳刺伤的位置相同。血雾中浮现出数百具悬浮的尸体，他们的皮肤下缠绕着红色藤蔓，瞳孔里倒映着林羽的身影。
叶尘挥动弑天枪劈开血雾，枪尖却被藤蔓缠住。藤蔓突然爆发出刺耳尖叫，叶尘感觉自己的意识被拉入一个黑暗空间，看见无数个自己在不同世界中战斗、死亡、重生。
叶尘！林羽将青龙剑刺入藤蔓核心，金色血液顺着藤蔓蔓延。苏云萝趁机将朱雀笛插入地面，九只火凤虚影焚烧血雾。当烟雾散尽时，三人发现峡谷底部躺着数百具孩童尸体，他们的心口都嵌着半块龙纹玉佩。
这些是...龙卫基因库的实验体。苏云萝颤抖着取出玉佩，发现每块都刻着不同的编号。林羽握紧青龙剑，剑身裂痕中闪过未来世界的画面：穿着白大褂的苏云萝正在给婴儿注射基因融合剂。
你们终于来了。沙哑的女声从头顶传来。三人抬头，看见峡谷顶端站着一位身着黑袍的女子，她的容貌与苏云萝一模一样，只是左眼戴着机械义眼。女子掀开兜帽，露出后颈的实验体-苏云裳纹身。
我是来自2077年的苏云萝。女子取出一支银色注射器，为了阻止龙卫灭绝计划，我必须回收你们的基因。她按下注射器按钮，数百只机械蝗虫从峡谷两侧涌出，每只蝗虫都携带龙卫基因提取针。
林羽挥动青龙剑斩杀蝗虫，却见蝗虫尸体化作红色雾气重新凝聚。苏云萝的朱雀笛能量耗尽，叶尘的弑天枪卡在机械臂中。未来苏云萝突然将注射器刺入自己心口，绿色液体顺着血管蔓延：现在，我是机械龙卫-苏云萝号。
她背后展开机械翅膀，右手变成链锯，左手握着龙辰的断剑。林羽认出那正是广寒宫中的断剑，剑柄上的医仙谷符文此刻泛着红光。未来苏云萝挥动断剑劈开空间，露出里面漂浮的基因库培养舱。
龙辰在未来创建了龙卫基因库，而你们是第999次轮回的实验体。她将断剑插入地面，每次轮回失败，时空管理局就会重置世界。这次，我要亲自终结这个循环。
林羽突然将御龙令抛向空中，三道龙形光束交织成网。未来苏云萝却启动断剑的时空能力，将三人困在时间停滞的结界中。她用链锯切开林羽的手臂，取出一滴金色血液：这是融合了龙辰基因的神血。
苏云萝突然将朱雀笛刺入自己心口，鲜血喷在断剑上。断剑发出悲鸣，将未来苏云萝吸入时空裂缝。林羽看见裂缝中漂浮着无数个自己，有的穿着龙鳞甲站在金字塔顶端，有的握着未来科技武器与外星人战斗，还有的抱着苏云萝的尸体跪在九渊秘境。
当时间结界解除时，峡谷恢复平静。苏云萝从怀中取出一个水晶瓶，里面装着未来苏云萝留下的基因融合剂：她说，这是唯一能阻止世界大战的方法。叶尘启动机械臂，将融合剂注入林羽体内。
林羽感觉体内的龙卫基因与未来科技剧烈冲突，青龙剑碎片自动重组，变成了能吸收能量的弑星剑。他举起断剑刺入峡谷中央的祭坛，龙形光束瞬间笼罩整个西域。
当三人回到龙隐阁时，发现阁顶漂浮着一艘未来科技飞船。舱门打开，走出一位身着银色战甲的女子，她的容貌与苏云萝相同，但左眼角有龙鳞印记：我是时空管理局特工，来回收龙辰-999的基因。
林羽握紧弑星剑，剑身裂痕中闪过未来世界的战火。女子突然摘下头盔，露出后颈的龙卫-001纹身：龙辰在未来创建了龙卫军团，而你们是最后的纯种龙卫。她指向飞船内的培养舱，看看你们的未来。
三人透过舷窗，看见舱内沉睡着数百个克隆体，每个都与林羽容貌相同。舱体编号从龙辰-001龙辰-999，而第999号舱内是空的。女子取出一个水晶球，播放出未来景象：穿着龙鳞甲的林羽站在核爆后的废墟上，怀中抱着苏云萝的尸体。
这是第998次轮回的结局。女子将水晶球交给林羽，现在，你们有两个选择：被回收基因重启世界，或者跟随我去未来改变命运。苏云萝握紧朱雀笛，叶尘的弑天枪突然发出共鸣。
林羽将御龙令放在水晶球上，三道龙形光束交织成太极图案。舱内的克隆体突然睁开双眼，同时说道：我们都是龙辰的分身，只有融合才能终结轮回。未来苏云萝的声音从舱内传出：现在，回到基因库。
三人被吸入飞船，舱门关闭的瞬间，龙隐阁的梧桐叶开始逆向飘落。林羽看见舱内的克隆体们逐渐消失，取而代之的是八百个龙卫虚影。未来特工启动飞船，穿越时空裂缝时，苏云萝的玉笛响起，与未来世界的警报声重叠。
当他们抵达未来世界时，发现地球已变成一片焦土。龙辰的基因库悬浮在太空中，周围环绕着机械龙卫舰队。未来特工将三人带到基因库中央，指着悬浮的水晶棺：这里沉睡着初代龙辰的意识体，只有你们能唤醒他。
林羽将弑星剑刺入水晶棺，金色血液融入棺内。龙辰的虚影浮现，他的容貌与林羽相同，但左眼角有泪痣：我分裂出八百个分身，就是为了找到能终结轮回的变数。他看向苏云萝，你的朱雀血脉，是重启世界的关键。
苏云萝突然将朱雀笛刺入自己心口，鲜血喷在基因库的核心上。整个基因库开始重组，克隆体们化作数据流融入林羽体内。龙辰的虚影与林羽重合，叶尘的弑天枪变成了龙辰的弑天枪，苏云萝的玉笛则融合了未来科技。
现在，你们是新的龙辰。龙辰的声音在三人脑海中响起，去时空管理局，阻止最后的世界大战。基因库裂开一道时空裂缝，三人看见裂缝另一端，幼年的自己正握着反物质炮的扳机。
林羽握紧弑星剑，剑身裂痕中闪过所有轮回的记忆。苏云萝吹响朱雀笛，未来世界的战火在笛声中熄灭。叶尘挥动弑天枪，将机械龙卫舰队斩成碎片。三人携手跃入时空裂缝，龙形光束在他们身后闭合，将所有轮回的记忆封存在基因链中。
当他们再次睁开眼时，发现自己站在龙隐阁的梧桐树下。苏云萝的玉笛多了一圈龙形纹路，叶尘的弑天枪刻着龙辰-999的编号，林羽的青龙剑裂痕中流淌着金色血液。三人腰间的地图出现新的标记：时空管理局，位于不周山巅。
现在去哪？叶尘踢开脚下的黄沙。林羽望向北方，那里漂浮着龙辰基因库的残骸：去不周山，我要弄清楚为什么所有未来都指向世界大战。苏云萝突然指向天际，云端浮现出龙卫-001的编号，落款是。
三人启程时，叶尘的弑天枪再次震动。枪尖在沙地上划出一行字：不周山巅，藏着龙辰的真相。林羽握紧青龙剑，剑身的裂痕中闪过未来世界的和平景象。一场跨越时空的龙卫传奇，才刚刚进入高潮。