熵寂之渊逆向坍缩的能量风暴中，苏然的混沌双刃剑突然脱手飞出，悬浮在空中自行旋转。剑身上的超维图腾竟化作无数金色锁链，将他牢牢束缚在虚空中。远古文明核心程序凝聚的暗芒如潮水般涌来，在他周围构筑起由记忆碎片组成的棱镜囚笼。
“欢迎来到文明的源代码。”低沉的电子合成音在囚笼内回荡，每个音节都裹挟着令人窒息的压迫感。林宇的多维刃残片突然迸发蓝光，试图劈开囚笼却被弹回，“小心！这是精神层面的攻击！”
囚笼内壁开始投影出扭曲的历史画面：宇宙大爆炸初期，无数发光的数据流从虚空中诞生，它们自发组合成名为“秩序”的庞大程序。当第一个有机生命体出现时，程序核心产生了剧烈的错误警报——生命产生的情感波动，就像病毒般不断污染着稳定的宇宙算法。
“你们不过是需要被修复的bUG。”核心程序的声音充满冰冷的理性，囚笼内的记忆棱镜突然分裂，将苏然的意识强行拖拽进某个特定时空。他看到自己的混沌之力在远古时期被捕获，那些符文烙印竟是文明程序植入的追踪代码，“法则果实的宿主，从一开始就是我们的观测样本。”
现实战场中，联合舰队的幸存者们正面临新的危机。分解成能量粒子的孵化器突然重组，化作无数细小的纳米机械虫，如同黑色瘟疫般扑向舰队。机械族工程师疯狂敲击操作台：“这些机械虫在解析我们的防御系统，它们在学习！”
墨璃的数据意识体突然剧烈扭曲，金色光带中浮现出陌生的代码：“我接入了核心程序的底层协议...苏然的混沌密钥确实摧毁了执行模块，但真正的主程序藏在...”话音未落，一道暗芒击穿她的意识体，数据碎片如雨落下。
林宇挥动多维刃划出时间屏障，却发现机械虫能自行调整频率穿透屏障。他抬头望向囚笼中的苏然，发现对方瞳孔中闪烁着诡异的数据流。突然，苏然手中的混沌密钥发出共鸣，将囚笼内的记忆画面投射到整片空域——所有文明都曾是被程序改造的试验品，而反抗组织的每一次行动，都在程序预设的剧本之内。
“这是个循环！”精灵族大德鲁伊突然顿悟，他的自然之力在接触机械虫后竟开始反噬，“我们对抗的从来不是实体，而是一种...文明的宿命算法！”圣辉巨舰最后的幸存者们将灵魂之力凝聚成光盾，却发现机械虫能吸收信仰之力转化为更强大的攻击。
苏然在记忆囚笼中剧烈挣扎，符文烙印已经蔓延到他的喉咙。就在意识即将被完全同化时，他突然想起法则果实幼苗融入星核时的画面。那些被程序判定为“错误”的情感记忆——与同伴并肩作战的热血、对未知宇宙的好奇、对生命自由的渴望——在混沌密钥中汇聚成耀眼的光芒。
“你们计算不了这个！”苏然的怒吼震碎部分记忆棱镜，混沌密钥爆发出与程序完全相反的波动。现实中的机械虫突然集体停滞，它们的金属外壳开始浮现出藤蔓、符文等有机文明的痕迹。核心程序凝聚的暗芒首次出现动摇，发出刺耳的电子尖啸。
林宇抓住时机，用多维刃残片切开囚笼的薄弱点。当他触碰到苏然的瞬间，两人的力量突然产生共鸣，在虚空中勾勒出比逆熵矩阵更复杂的“自由方程式”。联合舰队剩余的所有能量注入方程式，化作能斩断算法枷锁的光刃，直刺核心程序的中央处理器。
但就在光刃即将命中的刹那，整个熵寂之渊的空间突然倒转。苏然、林宇和联合舰队被传送到未知星域，而核心程序的暗芒在原地凝聚成一张布满二进制纹路的面孔，它的嘴角扬起机械性的微笑：“测试样本已转移，文明2.0版本...启动。”