平静的日子没过多久，草原上突然出现了时空乱流，将羊村的一部分和周边的区域卷入了不同的时空。喜羊羊等人发现，原本熟悉的草原场景与各个奇异的时代相互交错，一会儿是恐龙称霸的远古时期，一会儿又变成了充满机械的未来世界。
小羊们和灰太狼被分散到了不同的时空片段。喜羊羊身处远古时期，周围是体型巨大的恐龙。他运用万物之力与恐龙交流，得知时空乱流是因为一颗神秘的宇宙陨石坠落在了时空的节点上，扰乱了时间秩序。
沸羊羊在未来世界遇到了各种高科技武器的攻击，幸好灰太狼发明的装备能勉强抵御。他一边躲避攻击，一边寻找回到伙伴身边的方法。在这个过程中，他结识了一个未来世界的小机器人，小机器人告诉他，要修复时空乱流，需要找到三把分别代表过去、现在和未来的钥匙，它们散落在不同的时空。
美羊羊在一个神秘的中世纪魔法世界，这里的人们被黑暗魔法笼罩，陷入沉睡。美羊羊用治愈能量驱散了部分黑暗魔法，当地的魔法师告诉她，其中一把钥匙就在这个世界的魔法塔顶端，但那里被强大的魔法守护着。
懒羊羊误打误撞来到了一片神秘的仙境，这里的仙灵告诉他，他体内的神秘力量与时空有着紧密的联系，只有充分激发这股力量，才能找到三把钥匙。于是，懒羊羊开始在仙灵的帮助下修炼，努力掌控这股神秘力量。
小灰灰在一个充满蒸汽朋克风格的世界，他利用自己的灵活优势，在复杂的机械建筑中穿梭。他发现这里的人们正在制造一种能定位时空物品的装置，或许能帮助找到钥匙。
喜羊羊决定先集合伙伴，他通过万物之力发出信号，试图与大家取得联系。沸羊羊带着小机器人，美羊羊在魔法师的协助下，懒羊羊在仙灵的陪伴下，小灰灰带着蒸汽朋克世界的定位装置，纷纷朝着信号源前进。
在经过一番艰难的穿越时空之旅后，他们终于在一个奇异的时空夹缝中重逢。此时，懒羊羊已经成功激发了神秘力量的新形态，这股力量与时空乱流产生了奇妙的反应，为他们指引出了三把钥匙的位置。
众人兵分三路，分别前往不同的时空寻找钥匙。喜羊羊和沸羊羊来到魔法世界，历经艰险爬上魔法塔，战胜了守护魔法，拿到了代表过去的钥匙；美羊羊和小灰灰前往蒸汽朋克世界，利用定位装置找到了深埋在地底的代表未来的钥匙；懒羊羊则凭借神秘力量，在仙境的一处神秘洞穴中找到了代表现在的钥匙。
当三把钥匙汇聚在一起时，发出了强烈的光芒，与神秘陨石产生了共鸣。喜羊羊带领大家将钥匙的力量注入陨石，成功修复了时空节点，时空乱流逐渐平息，羊村和草原终于恢复了原样。
经过这次冒险，喜羊羊和伙伴们对时空的奥秘有了更深的了解，他们也更加珍惜现在平静的生活，同时也做好了准备，迎接未来可能出现的任何挑战 。
草原重归宁静后，喜羊羊和伙伴们本以为能好好休息，可命运似乎总爱给他们出难题。一天，慢羊羊村长在观测星空时，发现有一组神秘的信号频繁朝着羊村发射，这些信号带着一种奇特的波动，仿佛在召唤着什么。村长召集众人，商讨对策。
经过一番研究，大家决定顺着信号的方向探寻真相。他们乘坐着灰太狼改造的飞船，穿越层层云层，来到了一片神秘的未知海域上空。从高空俯瞰，一座被迷雾环绕的孤岛出现在眼前，信号正是从这座岛上发出。
降落后，众人小心翼翼地走进岛内。岛上静谧得有些诡异，除了风声，听不到任何其他声响。走着走着，他们发现了一座古老的城堡，城堡大门紧闭，门上刻满了奇怪的符号。沸羊羊用力推了推，门却纹丝不动。
这时，懒羊羊肚子饿了，他随手捡起地上一块形状奇特的石头，没想到刚握住石头，城堡的大门竟缓缓打开。里面弥漫着一股陈旧的气息，昏暗的光线中，隐约可见墙壁上挂着一幅幅古老的画像，画中人物眼神深邃，仿佛在诉说着不为人知的故事。
深入城堡后，他们来到一个巨大的房间，房间正中央摆放着一个散发着蓝光的水晶球，信号就是从水晶球发出的。正当喜羊羊准备靠近查看时，房间里突然涌出许多机械傀儡，将众人团团围住。这些傀儡行动敏捷，攻击力极强。
灰太狼迅速拿出武器反击，沸羊羊则与傀儡近身搏斗，美羊羊为大家提供治愈能量，小灰灰灵活地穿梭在傀儡之间，寻找它们的弱点。而喜羊羊发现，水晶球的光芒似乎能影响傀儡的行动，他集中万物之力，试图控制水晶球的能量。
懒羊羊也在一旁努力调动神秘力量，与喜羊羊的万物之力形成呼应。在两人的配合下，水晶球的光芒越来越强，机械傀儡的行动逐渐迟缓，最终全部停止了运作。
解除危机后，他们终于得以仔细研究水晶球。通过水晶球，他们看到了一段古老的记忆：原来，这座孤岛曾是一个强大文明的所在地，他们掌握着操控星辰的力量。但一场突如其来的灾难让文明覆灭，他们将最后的希望寄托在这个水晶球上，希望有朝一日能有人借助星辰之力拯救他们的文明。
喜羊羊和伙伴们被这段历史深深触动，他们决定帮助这个古老的文明。在接下来的日子里，他们根据水晶球的指引，收集散落在世界各地的星辰碎片。每一片碎片都隐藏着巨大的能量，也伴随着各种危险。他们克服了重重困难，终于集齐了所有碎片。
当星辰碎片汇聚在水晶球周围时，一股强大的力量爆发出来，光芒照亮了整个孤岛。在光芒中，古老的文明开始复苏，城堡变得焕然一新，岛上也重新充满了生机。
完成使命后，喜羊羊和伙伴们告别了这座神秘的孤岛，回到了草原。他们知道，这次冒险只是众多未知中的一次，未来，还会有更多的挑战等待着他们，但只要团结一心，就没有什么能够阻挡他们守护家园和探索未知的脚步 。