晚上谢远去侦察小窝棚，蔡坚冒险潜入一户死绝户的人家，这一家人三口人是在他眼皮底下去逝去的，蔡坚找了一块包袱皮，他回想了一下哪里曾经有过呕吐物和排泄物。蔡坚用刀把那些地方的土刮出来，用包袱皮小心包了一包土。
蔡坚潜行至小窝棚不远，与谢远汇合。谢远告诉他窝棚里有人，泉眼那里没人。蔡坚不让谢远接触那包泥土，自己带着那包泥土潜行至泉眼旁，把土倒进了储水坑。蔡坚也不清楚这样能不能起到作用，那家人的地面曾经用石灰水消过毒，一切都要看天意。
白天小鬼子没有发现泉水中的异样，厨房像往常一样做好了饭，用手沾水捏成了饭团，送到了祠堂，荣字1644部队的鬼子们吃的津津有味。
老天总算没有完全瞎眼，白天鬼子们一切如常，到了晚上断崖台阶上的谢远、蔡坚发现祠堂里乱了套。原来是有4个鬼子感染发作了，祠堂里一片慌乱，鬼子们用担架抬着感染的鬼子出了山坳。祠堂门口的鬼子们忙着相互检查防护服，发现都没有问题。但他们还是下意识的不敢进祠堂。
谢远、蔡坚趁着这个机会潜入祠堂，把鬼子相机里的胶卷换了出来，用自己新胶卷拉开曝光后又卷进了相机。并用自己的相机拍摄了大量鬼子的资料。然后两人趁乱又返回到断崖台阶上。
荣字1644部队的小鬼子最终没敢进祠堂，在祠堂门口坐了一夜，后半夜又有二人发作，当小鬼子再次送感染的鬼子出山坳时，负责防卫的河野混成旅团士兵远远就用枪对准了他们，命令他们返回小山村。日军已收到命令谁也不准出山坳，荣字1644部队的小鬼子又失魂落魄的返回了小山村。这群畜牲终于尝到了自食其果的味道。
断崖上谢远、蔡坚分处两个台阶，这是蔡坚要求的，他怕自己会感染影响到谢远。
天亮了一队穿着防护服的日军进入了小山村，原来的小鬼子全部隔离了起来，石井四郎和增田知贞都来到了小山村。
这是一起严重的事故，石井四郎、增田知贞明显感觉到了衢州驻军对他们的不信任。这也是人之常情，穿着防护服的1644部队都被感染了，如果疫情扩展开来，普通士兵如何自处。石井四郎、增田知贞要尽力挽回这一影响。
两人一来就着手调查感染原因，这里施放的病毒除炭疽外，都是消化系统传染性病菌，于是日军首先就从食物、水源方面入手。不到一天就查到水源受到了污染，排除人为投毒的可能，泉水中病毒浓度不高，也没有异物、祠堂也无外人侵入的痕迹。
接下来就是对感染的鬼子进行治疗，虽然日军能对感染人员补液，但针对性抗生素缺乏。此时剩下的小鬼子都相继发作，两天下来，还是有7名鬼子见了阎王，其余的病情稍微稳定些，而小山村的村民没有得到任何帮助，死亡超过了一半，尤其是老人、小孩死亡率更高。
日军在小山村待了5天，小鬼子又死了2个，其余的病情稳定下来了。日军撤围了，感染的鬼子也被送往了衢县，小山村遭到了毁灭性打击，陷入了一片死寂。不大的村子人员损失了七成，周边村落也不欢迎小山村的人，小山村陷入了孤立。幸存下来的人活得仿佛行尸走肉一般。小山村的劫难还远没有停止，十年、二十年后会还不断有村民受到病毒的遗害。许多的村民得了一种烂脚病，受害者出现皮肤溃烂、伤口无法愈合，肢体坏死等症状，严重的会导致败血症，出现死亡。这是受到炭疽病毒的感染，这些炭疽病毒甚至在60年后仍能具有杀伤力。
谢远、蔡坚又在小山村又待了4天，协助防疫。感染的村民命大的基本上身体基本上恢复了，该死的也死绝了。两人对于小山村受到周边歧视也是无能为力，他们退回了山中秘营，隔离了一段时间，所幸没有感染病毒。林沧海潜回了衢州，还没有回来。
秘营留守人员向李振华发报，报告了林远、蔡坚的发现。李振华命令谢远、蔡坚俩人退回福建与区晨汇合，把文件、胶卷交给区晨保存。
军统戴雨农亲自来到了福建南平，从区晨的手中接过了日军密码本，日军俘虏，日军细菌战资料。这是延安总部经过充分考虑后所做的决定，日军密码本6一8个月更换一次，我党在密码破译上还没有实力能跟上日军更换的频率，交给国党可以交换一部分利益，国党破译密码的能力比我党强的多，有现成的密码有助于国府寻找到日军新密码的规律，这对抗战有利。至于日军俘虏、日军细菌战资料交给国府，那是因为这涉及到国际交涉，以国府的名义做事才名正言顺。
11月初国府的中央日报、扫荡报，中共的新华日报、解放日报，私营的大公报相继发出了日军在浙赣战役中实施细菌作战的系列报道，有系列照片、甚至有日军文件，还曝出了日军专门实施细菌战的部队番号：关东军防疫给水731部队和南京荣字1644部队，两支部队的部队长石井四郎、增田知贞的相片登上头版。这一系列的证据形成一个完整的证据链。国府把两人定为战犯，悬赏百万银元取两人的脑袋。报道中根据从小山村缴获日军的文件、笔记可以判断出这两支部队在实施人体活体实验，从照片上可以看出这些活体样本除了东方面孔，还有欧美面孔之人。
这些报道在国内外引起了轰动，西方报纸也纷纷转载。各国领导人也对日军这种行为进行了谴责，并认为这是彻底的战争犯罪行为，会遭到国际社会对等报复，战后还要追究到底。德国希特勒、意大利墨索里尼也向日本表达了不满。日本在国际上陷入空前孤立，外交上陷入被动。
日军大本营参谋部为摆脱战后被追究，下令缩小细菌作战的范围，限定只能在飞机场周边使用。石井四郎、增田知贞被当头一棒打的眼冒金星，两人都意识到此战过后，他们可能不会有好的结局，细菌部队的发展也会受到很大的抑制。问题是此次泄密还是他们部队的责任，这让石井四郎、增用知贞有苦难言。