奇才摧枯拉朽攻破纽约防御的事件使得最高统帅部对他愈发信任，在苏军主力部队完全登陆之前还需要尽可能肃清海岸防御力量。
奇才被召回莫斯科，罗曼诺夫亲自给他下达了任务指令—击溃美国在旧金山的防御力量。
虽然从东海岸战区调到西海岸战区跨度太大，但是奇才并没有任何不适应，再次从莫斯科前往苏军的太平洋舰队。
旧金山战区，加尼福利亚舰队和海岸警卫队依旧在负隅顽抗，依靠近岸的四门巨炮，美军可以拒舰队于射程之外。这些巨炮便是奇才这次任务所要处理的首要目标。
苏俄的太平洋舰队远不及美国的特混航母编队强大，拉丁同盟正在竭尽所能拖住驻扎在南美的美军主力舰队回防，但是他们不可能一直限制住美军舰队，奇才必须抓紧时间了。
在奇才到来之前，对旧金山的进攻已经开始。为防御苏军的基洛夫飞艇，美军在此部署了相当数量的爱国者导弹阵列。防空飞弹成功拦截了基洛夫飞艇，但时机似乎没有把握好，基洛夫飞艇下落的残骸砸向了下方的金门大桥，旧金山两块陆地之间的连接即将被切断。
等到奇才率领舰队到达战区外围海域时，金门大桥已经彻底毁坏，奇才原本制定的进攻计划还得临时更改。
加利福利亚舰队主力由驱逐舰构成，对付它们奇才还是老办法，台风潜艇吸引反潜机出动推算驱逐舰位置，海浪炮艇截击反潜机，最后台风潜艇用鱼雷收场。这种办法屡试不爽，巡逻的两艘驱逐舰被鱼雷炸沉。太平洋舰队如入无人之境，无畏舰的导弹摧毁了海岸边单独的巨炮，苏军在外围海域的限制已经消失，是时候大干一场了。
美军的火箭飞行兵前来探查，立刻就被海狼炮艇击落，尸体掉落进海底。他们唯一的作用是让对方意识到了不对劲，加利福尼亚舰队围了上来，加利福利亚舰队冲了上去，加利福尼亚舰队打出了GG。
没有配套的护航编队，即便是航空母舰也不过是移动的靶子。驻守此地的美军指挥官竟然让护航驱逐舰和航母分开行动，被奇才逐个击破。因为奇才的出色表现，此地的美军指挥官倍感恐惧，不再贸然出击，调回了剩余的舰队保卫船厂，同时向上级求援，国防部同意了他的求援，表示不久后会有舰队支援让他再坚持一会儿。
奇才没有贸然向前推进，他先派出侦察机侦查西北的美军基地，确定没有埋伏后开始准备登陆作战。登陆作战首先需要清理掉滩头阵地，导弹砸在美军阵地上，火光冲天。阵地旁的船厂还有少数几艘幸存的驱逐舰，它们有反潜能力不假，可要是克制的对象数量达到一定程度，原本克制的关系就会反转。数十发鱼雷同时撞上一个目标，没有一种船还能幸存，即使是船厂，也会在不间断的攻击下消亡。
至此美军在旧金山西北方向的基地已被苏军封锁，金门大桥已毁，两段陆地之间已经断开，西北方向的美军已是瓮中之鳖。封锁完成后，奇才开始清理剩下的威胁，台风潜艇和无畏舰兵分两路，一路去处理残存的加利福利亚舰队，另外一路前去清理岸上的巨炮。
就在奇才准备行动时，一则通讯突然传来。“将军同志，久仰大名。我是心灵部门的主管兼总理的首席顾问尤里，请问您能否清理掉恶魔岛上的防空系统以便我们的人员进驻。我们会有一份给盟军的惊喜会在那里准备。”
“好的，尤里同志。等我向最高统帅部请示一番。”奇才回答道。
“不不不，将军同志。这项研究属于高度机密，暂时还不能让最高统帅部知道，等到研究完成，我会亲自向总理汇报。”尤里的声音有些奇怪，奇才听到后稀里糊涂地答应了。
挂断通讯，奇才恢复了神志。重新开始发起进攻，剩余的舰船和破碎的岸防线根本无法阻挡苏军的凶悍攻势，一轮攻击下，加利福尼亚舰队——全军覆没。岸防线也在无畏舰的不间断轰击下倒塌，巨炮的射程还是不及无畏舰的导弹。现在旧金山基地只剩下无畏舰射程之外的守军和奇才故意留下的建筑。
这时，国防部承诺的援军终于赶到，但为时已晚。奇才在战区外围设置的潜艇部队恭候多时，刚刚进入战场的舰队顷刻间消失在了汹涌的浪花下，鱼雷爆炸掀起的浪花下。
伴随着美军海防的全面崩溃，苏军终于肯放心将登陆部队放出，来自拉丁同盟的部队，破坏神载具和运输艇带来了火与电的组合，喷火兵和磁爆步兵让美军的建筑和纸糊的没区别。美军的滩头阵地失守。
奇才赞赏拉丁同盟喷火兵的高超技艺，竟然能在用白磷火摧毁建筑的同时不点燃旁边的油桶。美军在旧金山西北的阵地已归于苏军。奇才派出工程师占领了美军的部分基地，顺便接管了一座科技发电厂，开始使用美军军备。解决完西北方向的问题后，奇才看向恶魔岛，看着岛上密密麻麻的导弹基地和天火坦克皱起眉头。
求救消息再次传到五角大楼，汤姆大为震惊，他在犹豫是否还要继续派出援军支援旧金山。手下将军们意见不一，最后汤姆寻求康纳意见，盟指了解情况后建议放弃旧金山，这时候再派援军已无济于事。部长也同意他的意见，可他必须考虑其它因素。汤姆拨通了与总统的电话，杜根同意了撤退的计划，这无疑会打击士气，但他们毫无选择。和总统商议后汤姆给了盟指一个新任务。
撤退的命令下达，可留守的部队却再也无法活着离开了。苏军的援军已经抵达，配合原有部队，奇才完成了对美军残军的包围，在苏军愤怒的炮火声中，旧金山宣告易主。
最后就是恶魔岛的问题了，奇才直接一个电话打到了克林姆林宫，询问总理的意见。罗曼诺夫见是尤里的计划便同意了，事后他把尤里叫来训了一顿，尤里保证以后会及时向他报告。奇才炸毁恶魔岛上的防空系统后，一架隶属于心灵部门的运输机划过，空投下几名超能力部队成员进驻恶魔岛开始实验。
“感谢您的帮助，将军同志。相信我们在未来也能合作地很好。”尤里很满意。
奇才没有管那些神秘的超能力部队和尤里的话，他开始正式接管旧金山。在美军基地的废墟中寻找还有用的东西。
“将军同志，好消息。根据搜寻到的通讯资料和上次的情报显示，美国总统就藏在得克萨斯州的圣安东尼奥。”