方宁和真孤来到了钢铁市，同时在真孤的带路下来到了精灵研究所，见到了一个很大的长方形机器。
真孤看着方宁笑道：“接下来就是见证奇迹的时刻，古代精灵会从化石醒过来。”又看向自己的助手问道：“李阿，一切是不是逗准备好了。”
助手李阿回答道：“是的，真孤博士！”
真孤博士把梦梦蚀喷烟雾得地方，和机器链接起来，接着操控机器并运作起来，不一会里面传出精灵的叫声。
“哒嗞！”
身上是黄色和蓝色的羽毛，头上一橘黄色的嘴巴，它看着周围的环境害怕的大声叫了一声，情绪很是不安。
“这是始祖小鸟，我们的实验成功了。”真孤博士看着已经复活的始祖小鸟，为自己实验的成功而感到了高兴。
方宁看到始祖小鸟很是慌张害怕，连忙过去抱住它“冷静下来吧，现在已经没事了，快点冷静下来始祖小鸟！”
始祖小鸟不断地攻击方宁，又发出了几声叫声，挣脱后连忙跑到了外面，它发了疯似的就叫个不停。
突然一颗大树突然长大出现在他们眼前，以及长出新鲜的黄色伙食，始祖小鸟看到后立马过去吃了。
方宁问道“真孤博士，这是怎样回事？”
真孤博士看着这颗大树，想了想对着方宁回答道：“我想这是因为古代种子，随着始祖小鸟一起复活了。”
一伙黑衣人突然出现在了实验所外面，看着正在吃果实的始祖小鸟，笑的很是得意：“这只始祖小鸟我们就接受了。”其中一黑衣人拿出装置，把始祖小鸟固定变成了泥像的模样。
方宁看到他们的衣服，很是生气：“又是你们这群人，精灵盗猎组织，有我在你们休想带走始祖小鸟！”
“路卡利欧，波导弹！”
“天蝎，劈开攻击。”
就在方宁和一人对战的同时，一个热气球上升到了半空中，还对着的对战那人喊道：“货物到手了，我们撤！”
真孤拿出精灵球出来，看着热气球扔了出去：“比雕，用啄攻击给我把气球弄破！”比雕从精灵球里出来，飞到那伙人的热气球那边用嘴刺破气球。
其中一个黑衣人从身上拿出精灵球出来，却突然收到一个消息把精灵球放了回去，看着他们恶狠狠的警告：“下一次，别在来妨碍我们！”
始祖小鸟掉落在空中，方宁连忙跑过去把它接住，真孤低下头想了想对着说道：“方宁，你带着始祖小鸟走吧，帮它寻找适合它的地方。”
“别跑！”方宁刚要追出去！
“别追了，现在是始祖小鸟要紧。”
电脑突然响了起来，对着方宁发布新的一个任务：“任务：“帮助始祖小鸟寻找，去寻找适合它的栖息地。”
方宁看着真孤博士有点为难：“可是，这是……。”
“对了前年我在一处森林见过几只始祖大鸟，我想在神奥地方还保存着古代的样子，所以它就拜托你了。”真孤博士看了始祖小鸟几眼，又朝着方宁看去。
方宁从身上拿出大师球对着始祖小鸟，对着它笑了笑说：“我们一起上路吧始祖小鸟，我帮你去寻找适合你住的地方。”
“哒嗞？”始祖小鸟看着方宁。
方宁在树上摘了几个伙食加上精心制作，做成了古代精灵喜欢吃的精灵食物的口味，送到了它的面前：“始祖小鸟，你愿意跟我一起走么？”
始祖小鸟吃了精灵食物就非常喜欢，看着方宁笑着点了点头，表示愿意跟他一起上路，方宁总大师球将它收了进去：“我收服始祖小鸟了！”
电脑响了起来：
训练家已接受始祖小鸟任务。
支线任务开启：始祖小鸟想飞的梦想。
方宁从树上摘了黄色果实后，和真孤说了一会话，就要准备上路了。
在路上拿出大师球，笑着说：“始祖小鸟，以后我们就是伙伴了请多多指教。”把大师球放回身上了。
方宁拿出手机，给蓝小染发过去一个消息和一个笑脸的表情：“小染，告诉你一个好消息，鲤鱼王已经进化成闪光锦鲤了。”走吧闪光锦鲤的照片发了过去。
方宁想着这个支线任务，始祖小鸟既然想要飞，那么就要开始对战不断累积经验，从现在开始练习吧。
他拿出大师球从里面放出来始祖小鸟，它一出来就要张开翅膀飞行，但立马就摔了下来，方宁蹲下来看着它：“始祖小鸟，我来帮你让你飞起来！”
“哒嗞！”始祖小鸟很是激动的看着方宁。
方宁让始祖小鸟扑动翅膀去学会飞，但是飞了好几次都失败摔了下来没有成功，眼珠子转了转看着始祖小鸟，喃喃自语：不让它对战进化，说不定始祖小鸟进化后流可以飞了。”
想到这里，看着始祖小鸟笑道：“始祖小鸟，我已经想到了让你飞起来的办法了，那就是对战让你进化！”
手机又响了，方宁看到是蓝小染回复的消息：“刚好，我去缘之市的华丽对战赛作为嘉宾，要去对战一场表演赛，那你去缘之市等我吧。”
方宁用手机回复道：“好，我现在就过去缘之市。”
“华丽对战赛？是不是以前我在电视上看到，第二季的小遥参加的那种么，刚好去缘之市顺便去瞧瞧去。”
方宁把始祖小鸟收回精灵球里面，向着车站走去，来到了车站售票那里买了车票，坐在车上拿出手机带着好奇心问了一句：“你表演赛对战的那人，他是不是神奥地方的冠军？”
方宁看到手机屏幕里，出现蓝小染回复的一句话：“这倒不是，而是擅长使用虫系的四天王阿娜尔小姐。”
方宁回过去：“小染，那么祝你好运，对了我现在买了车票就在车上坐着呢。”
“好。知道了。”
在手机上打开网页上网查了查关于这个阿娜尔，找到了她去年和冠军对战的视频，看的非常认真直到结束。
“好强呀！”