熊廷弼、王化贞两人第二个矛盾冲突是毛文龙功过问题。在联合朝鲜方面，大夏君臣心里其实也明白，让朝鲜出兵是不可能的，但暗中资助粮草是可行的。
“平买于朝鲜东山一带，谅该国惧贼并吞之祸，感我拒倭之恩，必不忍推托”。
所谓的联合朝鲜，具体来说就是在朝鲜义州地区秘密设立据点，招募逃亡辽民为兵，同时联合登莱水兵，不断侵扰大金与朝鲜边境和大金沿海一带。
虽然熊廷弼、王化贞两人在这一战略思想上基本一致，但实际操作上又各自为政。熊廷弼这边派出梁之垣领兵2500人前去朝鲜。王化贞这边则派出毛文龙领兵220人，前去朝鲜。结果是毛文龙这边先立功了，便是有名的镇江之捷。
大金东南边境的镇江，位于鸭绿江入海口，与朝鲜隔江相望。镇江人民并不服大金的统治，屡屡起义。所以，在镇江搞事情，有群众基础。
趁着镇江城主佟养元出城镇压民变，镇江有一生员叫王一宁，前往朝鲜，意图借兵攻打镇江，刚好遇上了毛文龙。王一宁、毛文龙两人一商议，便让王一宁回去策反降金汉将，做内应。
天启元年八月二十四日晚上，毛文龙带兵潜入镇江。镇江中军陈良策、生员王一宁等人叛变大金，作为内应，打开城门。
在内应外合下，毛文龙夜袭镇江，活捉镇江城主佟养元，杀其亲兵六十人，镇江城中军民和周边汤站、险山、长旬等小堡皆投降。
拿下镇江后，熊廷弼、王化贞、朝鲜三方都没有及时派兵支援。不久后，大金派五千八旗兵征剿镇江。毛文龙不敢据守，便退入朝鲜境内。
王化贞以镇江之役向朝廷报功，但熊廷弼却认为毛文龙操之过急，打草惊蛇，让大金有了防范之心。他评价镇江之役名为奇捷，实为奇祸。
虽然镇江之役歼敌不过六十人，但其意义重大，是当时为数不多的胜仗，一定程度上鼓舞了大夏士兵士气。朝廷也从王化贞之请，升毛文龙为副总兵，并从海上调一万登莱水兵，八千浙江水兵入朝鲜，由毛文龙来指挥，骚扰大金边境。
熊廷弼、王化贞两人第三个矛盾冲突是战守问题。熊廷弼主张防守，王化贞主张出战。但实际上，王化贞只有出兵收复海州的计划，并没有真正实施，不过嘴上说说而已。
对战守问题，兵部尚书张鹤鸣曾说道：“臣谓不必分战分守，要在战成其战，守成其守。”
张鹤鸣的意思很明确，经略、巡抚何必为战守问题争吵不休，是战是守完全取决于统帅的临阵判断。若是出战能胜，当然是要主动出击，歼灭敌人有生力量，鼓舞我方士气；若是不能胜，自然要依城据守。
然而，熊廷弼、王化贞两人矛盾继续加大，已经从工作方法的争辩，变成了意气之争。
熊廷弼、王化贞两人第四个矛盾冲突是兵力问题。熊廷弼主张辽东要三十万兵力，而王化贞却认为只需六万精兵即可，并曾放出豪言：“臣愿请兵六万进战，一举荡平，即有不称，亦必杀伤相当，保不为河西忧也。”
实际上，熊廷弼提出的三十万用兵计划，一年至少将花费1200万两白银，以当时的大夏财政来说，根本负担不起。
正如刑科给事中孙杰当时所说的，“今兵需三十万，饷需一千二百万，恐竭中国财力不足供也，兵贵精不贵多”。
熊廷弼、王化贞两人第五个矛盾冲突是联合蒙古的问题。熊廷弼主张林丹汗不可信，而王化贞主张收复辽东必须要联合蒙古。
在王化贞的坚持下，大夏朝廷赏赐三十万两白银给察哈尔部。而在天启元年十一月的时候，林丹汗也派出一万蒙古骑兵驻守黄泥洼。
王化贞接着向朝廷奏报：“先差黄把都儿领精兵一万堵往黄泥洼，已至镇夷边外，余即续到，前发用虏银不敷，乞再发稿赏。”
只是大夏财政已竭尽，九边军饷尚无能为力，哪里还有多余的钱去请林丹汗多派兵协助。实际上，敌人的敌人，即便是不能成为朋友，也应该借剑杀人。
林丹汗的目标是统一蒙古各部，而努尔哈赤却在扯他的后腿，不断分化内喀尔喀五部。从这一个角度来说，联合林丹汗的察哈尔部，共同对抗大金，是有利益共同点的。
但是打铁还须自身硬，想要别人帮你，首先得让别人相信你有这个能力。大夏在正面战场上节节败退，一胜难求，林丹汗怎么可能为了区区三十万两，让自己的将士为别国卖命。
假如是顺风局痛打落水狗，还能赚赏银，别说林丹汗的察哈尔部不会拒绝，就连朝鲜也会出兵。所以，双方的军事合作也就是点到为止。
但毕竟察哈尔部也拉了一万骑兵过来，给大夏壮了声势。所以，王化贞主张收复辽东必须要联合蒙古显然是正确，只不过看双方能合作到什么程度而已。
对于熊廷弼、王化贞的矛盾冲突，大夏皇帝的态度一直就是很暧昧，一直在和稀泥，来来去去就那些话，“经抚共事地方，但当同心并力，以灭贼为务，毋误封疆大计”。但问题就在于经抚不和，且难以调和。
天启元年十一月，辽东巡按方震孺上疏，说臣虽极力调和，但经、抚两人已经水火不容，且事事相左，下面各道臣、各将领都不知道何去何从，再这样内斗下去，恐怕会扰乱军心、降低士气，还望陛下早做打算。但大夏皇帝依然犹豫不决，又转交兵部研究。
一直拖到天启二年正月，兵部尚书张鹤鸣召集九卿众臣82人，主持召开会议，研究辽东经、抚不合的问题。
会议上，有人主张撤经略以巡抚全权负责；有人主张撒巡抚以经略全权负责；还有人主张由张鹤鸣接任熊廷弼经略辽东；但更多的人还是和稀泥，主张责成经、抚两人同心竭力。
会后，兵部尚书张鹤鸣把各人意见以清单列上，并建议皇帝调熊廷弼回来，赐王化贞尚方宝剑，将辽事全权委任。但皇帝依然是难以定夺，下旨让吏、兵两部再次研究。
“是时，中外皆知经抚不和，不蚤为处分，必致误事。乃阁诿之部，部诿之会议，言者又各有所相持未决。”
于是，吏、兵两部再次开会研究，最后定留王化贞，撤熊廷弼。而遇事当决未决，徒然浪费时间而已。
正当大夏朝廷久拖未决，研究再研究的时候，前方塘报传来大金大举进攻广宁的消息。吏、兵两部再向皇帝奏报，认为不可临阵易帅，请皇帝责令熊廷弼、王化贞两人放下成见，同舟共济。
第七仗，广宁之战。天启元年底，努尔哈赤将辽阳进行了修建，并迁国都于辽阳。努尔哈赤在迁都之后，决定大举进攻广宁。
大战前，大夏辽东兵力大概十九万，其中广宁地区十四万，山海、义州、锦州、宁远、右屯等地五万。大金动员兵力十一万左右，由努尔哈赤亲征。
天启二年正月十一日，大金八旗大军已经陆续聚集海州、牛庄等地。
天启二年正月二十日，大金八旗大军渡过辽河，直奔广宁而来。此时，熊廷弼终于从山海关出发，驻军右屯，并让王化贞守广宁，刘渠守镇武，祁秉忠守闾阳，罗一贵守西平。
二十一日上午，努尔哈赤大军围攻西平堡。熊廷弼派出刘渠，王化贞派出祁秉忠、祖天寿前去救援。结果，援军未能及时到达。
当天中午，八旗大军架云梯，从城头攻入，西平失守，守将罗一贵自尽。
拿下西平后，八旗大军继续往前推进，与刘渠、祁秉忠、祖天寿所领的三万多援军，在平阳桥激战。刘渠、祁秉忠双双阵亡，祖天寿败逃觉华岛，大夏援军溃败。
打到这里的时候，广宁城里虽然大概还有守兵十万，但战争已经结束了。因为广宁十万将士得知前线溃败后，准备献城投降大金。
从二十二日到二十四日中午，已经有大夏两名参将、六名游击、两名千总陆续派出使者，向努尔哈赤投降。
在广宁众将商议投降的时候，参将江朝栋知道事已不可为，急忙劝王化贞出城，并速速传迅熊廷弼。
就在这个危急关头，熊廷弼、王化贞两人的表现可是说是可恨。天天窝里斗，一到关键毫无用处。
王化贞仓皇出城，弃城而逃。而在右屯的熊廷弼得到紧急情报后，犹豫不决。闾阳监军邢慎言劝熊廷弼应马上入广宁，计擒叛将，以定军心，而另一名监军韩初命却觉得此时入广宁危险。最后，熊廷弼听从韩初命的意见，弃右屯而逃。
“邢慎言劝廷弼，力救广宁，计擒叛将。韩初命沮之。遂率众退还。”
一个是经略，一个是巡抚，却在关键时刻双双逃离。而此时，努尔哈赤还不知道辽东经、抚两人已逃离广宁，还以为广宁众将的投降是熊廷弼的疑兵之计，一直驻军沙岭不前。
直到二十四日，广宁众将派生员郭肇基举旗备轿，击鼓敲锣前来迎接，努尔哈赤这才半信半疑，缓缓前去广宁城。
到了广宁城东，努尔哈赤还是有点懵，总觉得有诈，怕中了擒贼擒王、关门捉贼之计，先派八旗大臣领兵入城。直到中午，大臣再请，努尔哈赤才真正踏入广宁城。
失去广宁地区后，大夏在辽东的控制权只剩下宁远、锦州到山海关一条窄长的辽西南走廊。
从正月十一日到二十四日，这十多天内天津、登莱两地水军和潜入朝鲜的毛文龙、梁之垣毫无动静，所谓的三方布置之策只不过是一纸空文。
也只有林丹汗在事后，派出蒙古骑兵对大金进去了骚扰。
“是日，着戴木布、阿山前去巡边，遇潜入边内之察哈尔蒙古人……白旗巴牙喇茂海率侦卒，沿边巡察，见察哈尔恭图贝勒属下之人入境……察哈尔贝勒恭图属下之二百蒙古人，前来夺粮。”
虽然广宁不战而降是不争的事实，但一直病休的辽东巡按方震孺说法更有趣味性。
方震孺向朝廷奏报，说王化贞想要策反汉降将李永芳，结果反被李永芳将计就计，策反了心腹爱将孙得功。孙得功败回广宁城后，煽动其他将领投降，散布遥言引起守兵恐慌，导致逃的逃、降的降。
但大金方面压根没提孙得功献城之首功。在入主广宁之后，努尔哈赤破格提拔了石天柱和刘参将、金游击三名降将，和赏赐了一批降将，独不见孙得功有奖赏。
再一个，孙得功只是一名参将，而广宁城中，大夏的总兵、副将（即副总兵）、参将、游击、千总共1583人。
若是广宁十万将士真的有心抗敌，单孙得功一人，怕是无力公开献城降敌。孙得功只不过是众多投降将领中的一员，并没有所谓的献城首功。
直到天启三年二月，兵部尚书董汉儒重查广宁之败，共列举叛逃及下落不明的高级将领共有67人，并建议皇帝，叛降大金的要株连亲族，弃城而逃的要立斩，不知下落的要派人去原藉追查。
“兵部尚书董汉儒请论广宁之役叛逃诸将。叛将刘世勋等二十九人，逃将蔡汝贤等九人，不知下落之将张应龙等二十九人。
叛将宜逮亲族立正典刑；逃将宜扭解来京，立斩市曹；不知下落之将或阵亡、或生还，宜行原藉，确查根究，分别优恤、逮治。”
辽东巡按方震孺之所以特地单提孙得功献城之功，要不就是道听途说；要不就是为了脱责。
战场上打了败仗，那是经略、巡抚的责任，但要是众将皆有投降之心，那巡按方震孺也脱不了干系。
两个月，方震孺在完成收尾工作后，终于以病请辞，逃出辽东这个火坑。方震孺侥幸置身事外，可熊廷弼、王化贞两人可就惨了。